У серпні 2004, лише за два місяці після оголошення про розпад Creed, новий гурт Марка, Alter Bridge випустив дебютний альбом. Колектив мав багаті гастролі, а 2007-го видав наступну платівку. Саме з нею до Марка прийшло перше визнання його гітарної майстерності. Її титульна пісня – Blackbird – була оздоблена спільним соло Марка і вокаліста Майлза Кеннеді, яке журнал Guitarist назвав найкращим гітарним соло всіх часів. Вже третій реліз гурту Alter Bridge, випущений восени 2010, буде названо «всеохоплюючим шедевром».